Em fevereiro de 1979 é inaugurado o Biotério Central da UNICAMP, com o objetivo de fornecer animais de laboratório para os pesquisadores da Universidade. Posteriormente, com o apoio da FAPESP (Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de SP), CNPq (Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico) e FINEP (Financiadora de Estudos e Projetos) e sob a liderança Prof. Dr. Humberto de Araújo Rangel, são desenvolvidos esforços para a instalação, na Universidade, de um Centro de Bioterismo com credenciamento e reconhecimento internacionais.
Assim, em 1985, nasce o Programa CEMIB, com o propósito de produzir colônias de animais livres de patógenos específicos (SPF – specific pathogen free) e de instalar laboratórios de controle de qualidade, para monitorar o status sanitário e genético dos animais fornecidos. Como desdobramento natural, as áreas de produção e os laboratórios passam a atender outras instituições do país e da América Latina, inaugurando um programa de prestação serviços.
A carência de um know-how consolidado em nosso país à época, estimula a procura por instituições da Europa, Ásia e Estados Unidos, que pudessem estabelecer programas de colaboração bilateral com o propósito de capacitar recursos humanos e orientar a estruturação das colônias SPF e dos laboratórios de controle de qualidade. Assim, com o apoio da Administração Superior da Universidade e das agências de fomento, são estabelecidas parcerias com grupos da Inglaterra, França, Alemanha e Estados Unidos, que viabilizaram a instalação de rotinas existentes em Centros de Bioterismo consolidados destes países, contribuindo para que o CEMIB obtivesse credenciamento pelo ICLAS (International Council for Laboratory Animal Science) e alcançando, nos dias atuais, o estado de CORE FACILITY.
Com a publicação da Deliberação CONSU-A 31/89 em 1989, é criado o Centro Multidisciplinar para Investigação Biológica na Área da Ciência em Animais de Laboratório passando a ser nacionalmente conhecido como CEMIB-UNICAMP. Ainda no mesmo ano, estimulado por consultores internacionais, a Direção do Centro institui, na UNICAMP, a carreira de Técnico em Bioterismo.
A partir de 1990, o CEMIB implanta o Conselho Científico. Formado por representantes das unidades usuárias de animais de laboratório da UNICAMP, esse Conselho, como estabelecido pelo regimento interno da Unidade, se torna responsável pela gestão técnico-administrativa do Centro, viabilizando convênios e parcerias internacionais e construindo um canal de comunicação com a Administração Superior da Universidade. Com uma atuação forte e participativa, o Conselho Científico, representado pelo Prof. Dr. Alberto Carvalho da Silva, apresenta, em 1997, ao Governing Board do ICLAS, a candidatura do CEMIB como Centro de Referência Internacional. Desde então, o CEMIB mantém um vínculo com aquela entidade.
Posteriormente, em 2013, o CEMIB passa a integrar o Programa de Qualidade Sanitária – ICLAS Laboratory Animal Quality Network (Performance Evaluation Program for Diagnostic Laboratory – PEP), atuando como único representante da Rede na América Latina. De grande importância para o controle da qualidade dos animais produzidos na UNICAMP, o programa que reúne laboratórios credenciados de outros países para certificarem as rotinas e resultados obtidos com a avaliação sanitária, ultrapassa as fronteiras da Universidade e, atualmente, contribui com a avaliação de colônias mantidas em instituições de outras regiões do Brasil. Em 2016, o Laboratório de Certificação Genética passa a integrar a rede ICLAS Genetic Monitoring Reference Program, cujo foco é o monitoramento genético de linhagens inbred utilizadas em todo o mundo. Mais recentemente, em 2019, o CEMIB se junta a outras instituições nacionais e passa a participar como Membro Institucional do ICLAS.
Com foco na reprodutibilidade da pesquisa biomédica, em 2023, o CEMIB conclui o processo de cadastro e inserção de suas linhagens de camundongos no repositório Mouse Genome Informatics (MGI). Em seguida, com a obtenção do RRID (Research Resource Identification) para as linhagens Unib, mantidas no Centro há mais de 20 gerações, o CEMIB reforça a sua participação como Centro de Referência Internacional. O RRID representa um sistema de identificação único e permanente que permite a caracterização de recursos experimentais, auxiliando pesquisadores a citar recursos-chave (anticorpos, organismos-modelo e projetos de software) na literatura biomédica contribuindo para a transparência e o rigor nos métodos científicos. O cadastro nessa base de dados aproxima as linhagens fornecidas pelo CEMIB daquelas utilizadas por grupos de pesquisa dos países de primeiro mundo, favorecendo a publicação de resultados em conceituados periódicos científicos.